Die Handlung des Jahres 2378

Die Katana erreicht Delvan, in dessen Orbit sich ein Peacekeeperschiff befindet. Es gelingt, sich vor dem Schiff zu verstecken und Counselor Velain nimmt Kontakt mit ihrer Schwester auf, die in der Zwischenzeit im Widerstand gegen die Peacekeeper ist, die Delvan nach dem Verschwinden Zhabias überrannten.
Überraschend wird die versteckte Basis des Widerstandes aufgespürt und aus dem Orbit bombardiert. Die Katana beamt das Außenteam und die Mitglieder des Widerstandes an Bord. Daraufhin gerät die Katana unter Feuer und die Herausgabe der Delvianer wird gefordert. Diese wollen ebenfalls an Bord der Leviathans gehen um diesen für sich zu erobern. Captain Needa entspricht der Bitte und beamt die Angehörigen des Widerstandes an Bord des Leviathans.
Diesen gelingt es tatsächlich das Schiff zu übernehmen. Sie fordern Captain Needa auf, die Katana ebenfalls zu übergeben, weil sie mit einem Schiff alleine keine Chance gegen die Peacekeeper hätten und deshalb die Katana dringend benötigten. Captain Needa lehnt ab und es kommt zu einem Kampf, den die bereits beschädigte Katana zu verlieren droht. Needa leitet die Selbstzerstörung ein, die jedoch wegen einer Beschädigung an dem entsprechenden System nicht ausgeführt werden kann. Sie läßt die Katana evakuieren, verschlüsselt den Computerkern und bleibt mit dem Elite-Force-Team zurück, um das Schiff zu verteidigen. Sie wird jedoch von den vordringenden Delvianern überrannt und mit ihrem Team festgesetzt.
Auf dem Planeten baut das Technikerteam um Lieutenant Yadeel die Captains Yacht in einen kleinen Angriffskreuzer um. Der Plan sieht vor, den Leviathan von den Delvianern zurückzuerobern. Während die Yacht Kurs auf den Leviathan setzt befreit Counselor Velains Schwester das auf der Katana zurückgebliebene Team und es zieht aus, um das Schiff zurückzuerobern.
Beiden Teams gelingt das Kunststück, es gibt jedoch Opfer zu beklagen. Counselor Velains Schwester stirbt bei der Zurückeroberung der Katana. Die neue Counselor betrauert ihre Schwester und kehrt dann mit der Katana und ihrer Crew in das Star-Trek-Universum zurück, das inzwischen zu ihrer Heimat geworden ist.
Der nächste Auftrag führt die Katana nach Varadan IV, einem Klasse M Planeten, auf dem sich eine Prä-Warp-Zivilisation befindet. Auf der Planeten wurde eine Wissenschaftstation eingerichtet, zu der der Kontakt schon wenige Tage nach Ankunft der Wissenschaftler dort abbrach. Die Katana wird beauftragt nach den vermissten Wissenschaftlern zu suchen.
Ein Außenteam wird auf den Planeten entsandt, das jedoch schon kurz nach der Ankunft ebenfalls verschwindet. Da die Varadaner wie Menschen aussehen, werden Commander Summers, Commander McCrae und Doktor Maddigan entsandt. Auch ein zweites Team bestehend aus Captain Needa, Lieutenant Yadeel und Counselor Velain verschwindet ebenso spurlos wie die Wissenschaftler und das andere Außenteam. Doktor Lazarus, der als ranghöchster und dienstältester Offizier das Kommando inne hat ordnet eine Untersuchung vom Schiff aus mittels der Sensoren an und untersagt weitere Außenteams.
Die Untersuchungen des Doktors sind schließlich von Erfolg gekrönt, denn man findet heraus, daß die Atmosphäre des Planeten bei allen nicht dort geborenen Lebewesen zu Verdächtnisverlust führt. Der Doktor ordnet daraufhin an, daß ein weiteres Außenteam bestehend aus Frank Lincoln und Yamin Aurel in getarnten Schutzanzügen nach den Vermissten suchen soll.
Commander Summers, Commander McCrae und Doktor Maddigan befinden sich derweil im Dorf und haben ihr Gedächtnis verloren. Sie sind zu respektierten Mitgliedern der Gemeinde aufgestiegen und sind eifrig mit einer Hexenjagd beschäftigt, denn die abergläubischen Dorfbewohner auf der Bildungsstufe des Mittelalters der Erde halten die blauhäutige Counselor, die Chefingenieurin mit den glühenden Augen und der ungewöhnlichen Stirn und die Captain mit ihren Trillflecken für Hexen. Die drei Frauen verstecken sich allerdings im Wald vor den Dorfbewohnern. Auch sie haben jede Erinnerung an ihr Leben auf der Katana vergessen und halten sich für Schwestern.
Frank Lincoln und Yamin Aurel folgen der Gruppe aus dem Dorf in der Hoffnung, einen günstigen Augenblick zu finden die Mitglieder des Außenteams wieder an Bord beamen zu lassen. Durch eine Unachtsamkeit beschädigt Aurel seinen Schutzanzug. Er verliert ebenfalls binnen Minuten sein Gedächtnis und legt den Schutzanzug ab. Die Dorfbewohner entdecken den jungen Mann und klagen ihn wegen seines Aussehens der Hexerei an. Sie machen mit ihm die Wasserprobe und versenken ihn gefesselt im Dorfweiher. Obwohl Lincoln dem Kollegen hinterherspringt kann er ihn nicht rechtzeitig genug im aufgewühlten, dreckigen Wasser finden um sich gemeinsam mit ihm zurückbeamen zu lassen. Auf der Krankenstation kann nur noch der Tod des jungen Mannes festgestellt werden.
Im Wald ist indes Zhabia Velain wegen des Genusses einer für Delvianer unverträglichen Gemüsesuppe erkrankt. Seeta treibt es aus Sorge um die Schwester ins Dorf, wo sie Werkzeuge für die Reparatur des Daches stehlen will, damit Zhabia wieder gesund wird. Sie wird dabei jedoch von Falyn McCrae überrascht, der die vermeintliche Hexe zu töten versucht. Es kommt zu einer Verfolgungsjagd und einen Kampf zwischen den beiden, in dessen Verlauf Seeta Falyn mit einer Mistgabel in Notwehr ersticht. Erneut kommt Frank zu spät um Falyn McCrae zu retten und erneut können die Ärzte nur den Tod des Sicherheitschefes feststellen.
Mit Hilfe der wieder an Bord geschafften Seeta gelingt es schließlich den Aufenthaltsort der beiden anderen fehlenden Frauen zu ermitteln. Auch die fehlenden Mitglieder des ersten Außenteams können ebenso wie die fehlenden Wissenschaftler schließlich lokalisiert und an Bord der Katana gebracht werden.
Während die Katana auf ihre weiteren Befehle wartet, versetzt das Oberkommando ein Squadron Attack-Fighter auf die Katana. Nach den Ereignissen auf Delvan hatte Needa um eine Verstärkung der Verteidigungsfähigkeit der Katana gebeten und als Reaktion sandte man dem Schiff das Squadron A-20 unter der Leitung des ungewöhnlichen Piloten Lew Sulik, der selten ein Blatt vor den Mund nimmt und ein gespanntes Verhältnis zu ranghöheren Offizieren hat.
Die Katana wird zu Starbase 215 beordert, wo ein Verfahren gegen Lieutenant Yadeel und Lieutenant Lincoln wegen Totschlages und unterlassener Hilfeleistung eingeleitet wird. Beide werden jedoch freigesprochen, weil Seeta nachweislich in Notwehr gehandelt hat und Frank Lincoln sein Möglichstes tat um Aurel und McCrae zu retten. Die Crew nimmt Abschied von den beiden verstorbenen Kollegen und wendet sich wohl oder übel dem nächsten Auftrag zu. Frank Lincoln wird zum neuen Sicherheitschef befördert und Marina DeSoto wird für die Alpha-Schicht an der Ops eingeteilt.
Auf dem Planeten Venkan hat ein Militärputsch stattgefunden, in dessen Verlauf Föderationsbürger gefangengenommen wurden. Die Katana erhält den Auftrag die Föderationsbürger zu befreien. Das Elite-Force-Team von Lieutenant Tannier arbeitet einen Plan zur Befreiung der Bürger aus. Das Kunststück gelingt, jedoch wird die Katana von einem unbekannten Raumschiff beschossen. Im folgenden Kampf werden zwei der Attack-Fighter schwer beschädigt und Lew Sulik und sein Wingman Ian Paice müssen auf dem Planeten notlanden, wo sie von einer Gruppe, die sich Freiheit für Aranar nennt gefangengenommen werden.
Commander Toreen Akida wird der Katana als Verbindungsmann zum Sternenflottengeheimdienst zugeteilt. Er ist Fachmann für den Planeten Venkan und soll beratend zur Seite stehen. Auch danach wird er als ständiger Vertreter des Geheimdienstes an Bord bleiben.
Die Katana muß sich kurzfristig zurückziehen, kehrt jedoch bald darauf wieder zu Verhandlungen zurück. Lincoln und Needa treffen sich mit dem Führer von Venkan und Verhandeln mit ihm über die Freilassung der beiden Piloten, die sich jedoch gar nicht in seinem Gewahrsam befinden. Diese wurden nämlich in ein Dorf der Gruppierung Freiheit für Aranar verschleppt. Während Ian den Entführern ablehnend gegenüber steht, beginnt Lew schnell mit den Zielen der Gruppe zu sympathisieren, die vorgibt von der Regierung Venkans unterdrückt zu werden und nur für ihre Freiheit kämpft. Es kommt zu ernsthaften Auseinandersetzungen zwischen den beiden Freunden.
Seeta Yadeel verläßt indes die Katana. Die vergangenen Erlebnisse auf Varadan haben ein Trauma ausgelöst und die Beziehung zu Andreas Summers belastet. Sie kehrt mit einem Shuttle heim zur Erde um eine Weile bei ihrer Familie zu bleiben, weil sie den Drang hatte dorthin zurückzukehren. Sie hofft, dort die Ruhe zu finden die Erlebnisse zu verarbeiten.
Auf der Katana herrscht Entsetzen über ihre Entscheidung das Schiff zu verlassen, zumal es mit dem Weggang Kell Widars zusammenfällt, der die Katana verläßt um ebenfalls wieder heimzukehren. Als Ersatz entsendet die Sternenflotte umgehend den Kadetten Tomm Lucas, der seine praktische Ausbildung auf der Katana als Navigator absolvieren wird.
Lieutenant Tannier führt mit seinem Nial-Jäger, der für die Sensoren der Venkaner unsichtbar ist, einen Aufklärungsflug über das fragliche Gebiet durch. Schließlich gelingt die Befreiung der fehlenden Crewmitglieder und man verläßt den venkanischen Raum.
Die Katana wird nach Babylon 5 beordert, wo Transportschiffe die Station nicht erreichen können, weil sie unterwegs von unbekannten Angreifern aufgebracht werden. Die Katana soll die Ermittlungen für Präsident Sheridan führen, da dieser einen Verräter in seinen eigenen Reihen vermutet.
Auf dem Weg dorthin kehrt Lieutenant Yadeel zurück an Bord. Der Heimaturlaub hat ihr gutgetan und auch die Beziehung zu Commander Summers scheint sich wieder einzurenken. Schon kurz nach ihrer Ankunft hat der Alltag sie wieder.
Kurz nach der Ankunft der Katana auf Babylon 5 gelingt es einem der angegriffenen Frachter zu entkommen, weil er von einer Staffeln Narnschiffe geschützt wurde. Der Captain gibt an, daß es sich bei den Angreifern um Centauri gehandelt habe.
Die Katana bricht zu den Koordinaten des Angriffs auf und entdeckt dort eine Spur, die ein offensichtlich defekter Angriffsjäger hinterlassen hat. Needa läßt Verfolgungskurs setzen. Schon kurz darauf wird die Katana jedoch von einem romulanischen Warbird angegriffen, der das Sternenflottenschiff bereits seit der Ankunft im Babylon 5-Universum verfolgt hat. Wegen des überraschenden Angriffs stürzt die Katana auf einem Planeten ab, der sich gerade in einer Eiszeit befindet. Die Brücke der Katana wird dabei völlig zerstört.
Nach längeren Reparaturen gelingt es schließlich die Kampfbrücke und den Antrieb wieder funktionstüchtig zu machen. Der Start gelingt und die Katana kehrt für die restlichen Reparaturen in den Sektor 001 zurück. Das Schiff erhält ein neues Hauptbrückenmodul (Intrepid-Klasse) und bricht mit einer Delegation Ondanesen auf zu deren Heimatplaneten, wo die Katana bei der Verbesserung der Infrastruktur helfen soll. Mit an Bord befindet sich Doktor Daniel LaPlace, Ariells Ex-Mann, zu dem sie nach der Scheidung kein gutes Verhältnis mehr hat.
Im Laufe des Flugs kommen LaPlace und Needa sich jedoch wieder näher. Sie muß jedoch erfahren, daß er sich mit dem Virus infiziert hat, das die ondanesische Bevölkerung befallen hat. Er wird auf dem Planeten bleiben und nach einem Heilmittel forschen. Noch vor dem Weihnachtsfest fliegt die Katana wieder ab und beendet damit auch eine Affäre zwischen Frank Lincoln und der ondanesischen Regentin.
Man macht sich zum Jahreswechsel erneut auf den Weg ins Babylon 5-Universum mit dem Auftrag, herauszufinden was die Romulaner dort getan haben und den Verbündeten auf Babylon 5 bei der Untersuchung der Überfälle auf die Transporter zu helfen.